Kvalitní defenzivní hráč, tvrdý, neústupný bek, který mohl hrát na postu středního záložníka nebo na stoperu. V Bohemce byl odmalička, kdy ke klokanům přišel v roce 1995 se Sparty Krč. V zelenobílém dresu odehrál pod vedením trenéra Petržely 4 roky. V roce 1999 přestoupil z II. české ligy do německého 1. FC Norimberk, kde se postupem času stal platným a uznávaným hráčem nejvyšší německé soutěže. V bavorském klubu patřil mezi největší persony. V Norimberku nakonec odehrál 8 sezón. Na přelomu desetiletí se podíval na chvíli i do reprezentace, za kterou sehrál 5 utkání. V roce 2007 se vrátil do Ďolíčku, kde před zaplněnými tribunami vedl klokany s kapitánskou páskou na ruce. V roce 2010 byl zvolen do nejlepší jedenáctky desetiletí Bohemians. V létě 2012 ze zdravotních důvodů ukončil aktivní hráčskou kariéru. Marek Nikl je velká persona klokanů, kdy v zelenobílém dresu odehrál několik neuvěřitelných sezón. Se svojí manželkou přispěl i na záchranu Bohemky nemalým finančním obnosem. Je členem “Družstva fanoušků Bohemians“.
1984-1994: Bohemians ČKD Praha / FC Bohemians Praha