Tabulka 2. liga (1998/1999)
2. česká fotbalová liga
| # | Tým | Z | V | R | P | Skóre | Bodů |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | FC Bohemians Praha | 30 | 23 | 4 | 3 | 62:12 | 73 |
| 2. | SK České Budějovice JČE | 30 | 22 | 6 | 2 | 65:18 | 72 |
| 3. | FC SYNOT Staré Město | 30 | 20 | 7 | 3 | 64:26 | 67 |
| 4. | FC MUS Most 1996 | 30 | 16 | 8 | 6 | 47:31 | 56 |
| 5. | FC Vítkovice | 30 | 13 | 7 | 10 | 40:37 | 46 |
| 6. | FC NH Ostrava | 30 | 10 | 10 | 10 | 28:28 | 40 |
| 7. | AFK Atlantic Lázně Bohdaneč | 30 | 9 | 10 | 11 | 25:32 | 37 |
| 8. | FC Zlín | 30 | 10 | 6 | 14 | 26:33 | 36 |
| 9. | FK VP Frýdek-Místek | 30 | 9 | 7 | 14 | 23:30 | 34 |
| 10. | FK Mladá Boleslav | 30 | 9 | 7 | 14 | 33:40 | 34 |
| 11. | FC Tatran Poštorná | 30 | 9 | 7 | 14 | 31:41 | 34 |
| 12. | SK Chrudim | 30 | 10 | 4 | 16 | 30:48 | 34 |
| 13. | SK Železárny Třinec | 30 | 8 | 6 | 16 | 32:52 | 30 |
| 14. | SK LeRK Prostějov | 30 | 8 | 5 | 17 | 24:39 | 29 |
| 15. | FK Hanácká kyselka Přerov | 30 | 7 | 5 | 18 | 27:56 | 26 |
| 16. | 1. FC Česká Lípa | 30 | 4 | 7 | 19 | 17:51 | 19 |